ファクタリングでは業者の人件費や登記費用、印紙代などの固定費を含む手数料がかかりますが、手数料の相場は売掛金の買い取り金額や売掛先の与信力などによって左右されます。特に2社間ファクタリングか3社間ファクタリングかによって手数料が大きく異なるので、この二つの方法を比較してみることがポイントです。この二つの手数料を比較してみると、2社間の割引率は10～30％で、3社間の割引率は5～10％になります。手数料を比較してみてなぜ2社間の割引率が高いかというと、2社間取引の方が売掛金回収リスクが高くなってしまうからです。
3社間取引だと売掛先から直接支払いがあるので安全性が高いですが、2社間取引の場合はいったん利用者が売掛金を回収してから支払うことになるので、それだけリスクが高くなってしまいます。このように3社間取引よりも2社間取引の方が手数料が高くなる傾向ですが、利用者の取引実績が高ければ手数料を安く抑えることも可能です。しかし初回からいきなり5％以下の安い手数料を提示してくる会社は悪徳である場合があるので注意が必要です。ファクタリングを利用した場合の入金額の計算方法は、手数料と留保金がどれくらいになるかを確認することがポイントになります。
留保金とは売掛金が入金されるまでの間、ファクタリング会社が手数料も含めて余分に預かるお金のことです。留保金は売掛金が入金されると、手数料や審査料などを差し引かれて返金されます。